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来源:市场资讯
- P) o) z/ Q8 z+ |# E1 ^* e/ K(来源:课题指南针)& {5 v$ p" e4 S l8 |- `5 Y3 l
上两期说了挽救实验的两种情况:同一个基因的沉默和过表达、以及A通过B调控的作用。今天我们说第三层:为什么要做分子的结构域和氨基酸突变的挽救实验?8 X3 [$ @! l' \/ _5 S. _# S
国自然科学假说是这样的:A作为蛋白苏木化修饰酶,通过对B蛋白进行苏木化修饰(SUMOylation),进而诱导B蛋白的磷酸化修饰及细胞核转位,从而启动下游转录调控程序,进而促进周细胞向成纤维细胞转分化,最后促进纤维化和疾病进展。* Z" C" q8 @% n4 m" {5 o; d" ]
上面的研究主题比较适合青C项目,细胞与分子层面的亮点有两个:* g( j7 s( E; x4 w
1)周细胞向成纤维细胞转分化;8 G0 O0 g1 u; G- {5 I2 @0 h
2)A对B蛋白的苏木化修饰及其介导的转录重编程。" `+ X0 z! _! ^; P3 @) w# W1 Z4 B3 F
在这个项目中,为什么要做A和B蛋白的结构域截断体以及氨基酸突变的挽救实验呢?
) f- t, ~) @6 T6 j8 V因为假说默认了:
1 R' ]+ o( h: E1 N5 X0 `4 ~1 k: ^" ?+ O1)B的苏木化是后续事件(磷酸化和核转位)的必要条件;) o+ P" O9 I8 Q: O
2)A是通过其自身的苏木化酶活性直接作用的。
; v0 f' o0 r) S; l% M' @但科学要求我们排除例外:
1 ^3 o$ ~1 J3 a) S3 _% \伴随现象:苏木化只是磷酸化/核转位的伴随现象,而非原因。
8 S& n5 f( W7 q# Q% R; d间接作用:A可能只是招募了真正的苏木化酶C。
7 j$ |; R6 x! N) e4 H其它功能:A可能是通过其非酶活性的其他结构域(如D域)来起作用的。" f: Y/ u7 W% D
因此,必须挽救实验来验证:
0 O; d' G3 X k- @1 t" }1. B蛋白苏木化位点突变实验(如K→R):当B无法被苏木化后,A是否还能促进其磷酸化和核转位?( |! P8 j7 X! F4 c
若不能,则证明苏木化是必要的;若能,则假说不成立(可能是伴随现象)。7 P3 ^9 p0 Q/ s
2. A蛋白苏木化酶活性结构域突变实验:当A失去酶活性后,是否还能促进B的苏木化及下游事件?9 @+ T7 p- D0 W
若不能,则证明是A亲自执行的修饰,而非间接招募其它蛋白。
/ X( l! R% S- S5 X# M. p3. A蛋白与B蛋白结合结构域缺失实验:当A无法结合B后,是否还能影响B?, H) ]) R) B4 m; G( l/ Z
若不能,则证明二者的直接相互作用是功能基础。 |
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