|
|
来源:市场资讯
2 r. h- \3 o3 l! d5 p4 t# y(来源:课题指南针)
7 }5 i' H& G0 \) F8 Y9 {上两期说了挽救实验的两种情况:同一个基因的沉默和过表达、以及A通过B调控的作用。今天我们说第三层:为什么要做分子的结构域和氨基酸突变的挽救实验?
8 v7 \# D: z ~6 o# D$ i国自然科学假说是这样的:A作为蛋白苏木化修饰酶,通过对B蛋白进行苏木化修饰(SUMOylation),进而诱导B蛋白的磷酸化修饰及细胞核转位,从而启动下游转录调控程序,进而促进周细胞向成纤维细胞转分化,最后促进纤维化和疾病进展。
: N8 Z! {/ s0 Z/ d6 R) g) S8 |* A上面的研究主题比较适合青C项目,细胞与分子层面的亮点有两个:( x6 y Z: Q" v4 s8 f* y) E. E
1)周细胞向成纤维细胞转分化;3 X# k' t4 p: u+ O1 F
2)A对B蛋白的苏木化修饰及其介导的转录重编程。
+ G. C" W( K. t8 v在这个项目中,为什么要做A和B蛋白的结构域截断体以及氨基酸突变的挽救实验呢?
* w1 ?- l Q% v7 n) G4 _# j因为假说默认了:" P# Z$ u: W5 W5 v' I. B
1)B的苏木化是后续事件(磷酸化和核转位)的必要条件;
/ c$ F' v0 h( n5 I' I2)A是通过其自身的苏木化酶活性直接作用的。! T A6 A" k) Q7 T- ~+ x' w# a3 k
但科学要求我们排除例外:
2 E2 _; |3 j2 t$ o伴随现象:苏木化只是磷酸化/核转位的伴随现象,而非原因。
9 r% Q, Z' t Q; x D! o5 `. G间接作用:A可能只是招募了真正的苏木化酶C。
' F, V4 W" W/ b8 [) Q其它功能:A可能是通过其非酶活性的其他结构域(如D域)来起作用的。
: C7 v* Y% |0 q2 I因此,必须挽救实验来验证:4 @6 s n5 V+ g1 U" G5 P
1. B蛋白苏木化位点突变实验(如K→R):当B无法被苏木化后,A是否还能促进其磷酸化和核转位?1 H f& H. s, C0 v* {7 N: c6 D
若不能,则证明苏木化是必要的;若能,则假说不成立(可能是伴随现象)。
) ?& l6 d5 y4 ~- }" t) k7 @7 B2. A蛋白苏木化酶活性结构域突变实验:当A失去酶活性后,是否还能促进B的苏木化及下游事件?
( B- j3 O5 ?; r' E, n- t0 V若不能,则证明是A亲自执行的修饰,而非间接招募其它蛋白。" a& |$ s9 m+ z: v1 J
3. A蛋白与B蛋白结合结构域缺失实验:当A无法结合B后,是否还能影响B?) ]* d( v% x! ]; w( E
若不能,则证明二者的直接相互作用是功能基础。 |
|