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3 T" e7 W* |$ Z* ZBioArt人才
. W' a$ E5 O" Q7 l9 I西湖大学张垲课题组' O6 v+ Q. p3 d2 q
课题组和项目简介
6 @0 t/ W5 s) G1 d8 g9 H张垲博士于2018年获加州大学圣地亚哥分校(UCSD)生物信息学博士学位,2019–2023年在UCSD任兵教授课题组从事博士后研究,长期致力于基因转录调控网络研究,取得了一系列原创性成果,以第一作者在 Cell、Nature Methods、Nature Immunology、Nature Communications、SCIence Advances 等顶级期刊发表多篇论文。课题组已在单细胞表观遗传学领域积累了深厚的前期成果,自主开发了SnapATAC2(Nature Methods,2024)、Precellar (https://github.com/regulatory-genomics/precellar)等一系列高效、可扩展的单细胞多组学分析工具,并在全球范围内被广泛引用和应用;同时构建了海量高质量单细胞与表观遗传多模态数据资源库 (Cell,2021),为大模型训练、调控网络解析和疾病机制研究提供了坚实的数据和技术基础。 课题组目前聚焦基因转录调控机制,综合运用计算生物学、机器学习与多组学整合分析等跨学科手段,系统解析细胞分化、衰老及重大疾病的表观遗传调控网络。( Y1 O: B% e! {8 p2 S$ G0 ^3 V
因科研发展需要,现面向海内外公开招聘 博士后、助理研究员及科研助理若干名,主要参与以下项目:
( h; P& q \9 k1. 基因组学大模型构建与优化:整合海量单细胞与表观遗传等多模态基因组数据,开发面向生命科学的预训练基础大模型(Foundation Models)。通过底层算法创新,提升模型对顺式调控元件的精准识别能力,并实现从 DNA 序列到基因组功能及表型的跨维度预测。
9 w8 @0 t& C! ]2. 基于 AI Agent 的单细胞多组学智能解析生态构建:引入前沿的大语言模型(LLM)与多智能体(Multi-Agent)协同技术,构建开放、动态的分析计算生态。开发具备自主规划、工具调用与交互推理能力的 Agent 网络,打通从数据清洗到机制解析的“端到端”闭环。% X) Y2 u8 t [0 x, j& t& c( \
3. 肾脏疾病时空多组学解析与分子病理诊断模型构建(临床合作):联合北京协和医院肾内科陈丽萌教授顶尖临床团队,以高质量临床队列为依托,综合运用单细胞多组学(scRNA-seq + scATAC-seq)及空间转录组技术,解析肾脏疾病细胞类型特异性的致病网络,构建新型分子病理诊断 AI 模型。
) g5 ~. i: s+ ]课题组网站:https://lab.kaizhang.org
* W d1 U+ R7 Z ?$ p8 w3 t m工作地点:杭州市西湖大学云栖校区
6 ~; Y$ {9 g% y! v* p1 t, x联系人:张垲研究员
0 ?7 n' Z* Y0 r- X5 N招聘岗位及要求
! @- c9 `" V( V. V& h博士后/助理研究员(常年招聘)
+ b) o! [0 f8 s" U, u5 h) l岗位职责:
7 U& p" e) T9 T0 u1.独立或合作开展课题研究;# r$ k& S8 y' z9 @$ `3 I' p$ t
2.协助培养学生及科研助理;8 j1 h+ K& S W& q
3.撰写研究论文、综述;
7 P/ l7 u; u2 v4.独立或合作撰写基金项目申请以及参与学术交流
+ t% p4 R- {. P# H. ]应聘条件:
: n8 _/ b+ v# E& w8 ]1.已取得或即将取得计算生物学、生物信息学、人工智能、统计学、基因组学或相关专业博士学位;
/ ^& a2 u" Z4 E. l2 R% K2.有单细胞组学或表观基因组学研究经验者优先;2 x9 {' q7 M k2 G' x$ k
3.以主要作者身份发表过较高水平论文,具备良好的英文科研论文写作与学术交流能力;& N! K8 d$ U; s3 ^8 [
4.具有强烈的科研内驱力与团队协作精神。3 i9 H* v+ s: L9 W8 ^/ O3 u
科研助理(常年招聘), K: A2 h- _1 |& t
岗位职责:
% X! w/ q2 c2 J8 Q1.数据收集与管理:整理生物样本相关信息、数据预处理、建立和维护数据库;+ Z: `) k1 Q% G, W2 d
2.使用生物信息相关软件与工具进行数据分析、统计分析和可视化;
3 O7 h4 m$ d9 g; H( A3.协助实验室成员完成科研项目,或根据个人兴趣可自主承担课题项目。
2 b7 C; J9 x }# i5 `) S5 R应聘条件:+ K; f5 U _) }6 }
1.本科及以上学历,生物信息学、计算机科学、统计学或相关专业背景;% }7 I& X4 J' q R% |8 z
2.具备较强的数据处理、编程与可视化能力,能独立承担课题数据分析和流程开发任务;, s' f3 Y+ ` L- b
3.工作严谨细致,责任心强,能适应快节奏的科研环境。
8 W; R& ?% W4 y1 F% m2 z薪资福利及发展支持
% @" G1 [' E" r0 K1.与顶尖科研创新团队共事,提供充足的科研经费、高性能计算集群资源及国内外学术会议交流支持;
3 g9 m1 K. I2 k- b9 r: Q2.提供具有竞争力的薪酬待遇,博士后按国家及依托单位标准执行,表现优异者可优先推荐申报各类人才项目,优秀博士后出站可留校聘为助理研究员;助理研究员/科研助理待遇面议
: @( m; ^( S: ?* K8 `3.提供完善的社会保险、住房公积金、补充医疗保险、教职工年度体检等福利,加入工会后可享受工会会员福利,如节日及生日福利、教职工疗休养、参报医疗互助等;
1 t1 w$ j# r+ B2 ]8 u2 |* Q4.可享受杭州市博士后生活补贴(24或29万元/两年),可申请认定杭州市高层次人才,符合条件者可申请应届生生活补贴(博士10万元)、应届生租房补贴(不超过3万元)、博士后出站留来杭补助(40万元)' Y- a3 D, c0 b& r+ a+ F8 g
5.可享受杭州市博士后科研资助(10万元),对获得中国博士后科学基金资助和浙江省博士后择优项目资助的,杭州市给予1:1配套资助;
( k% h" Q* M, \: J- s, g1 q6.协助博士后申请国家自然科学基金青年项目、中国博士后科学基金及省部级人才计划;( }- x4 ^0 v. a% T7 d/ Y# |
7.课题组注重成员职业发展,全力支持优秀博士后出站后申请国内外高校教职或顶尖生物医药/AI企业研发岗位。
; `6 u! y! M5 H l% i5 C申请方式
" n) M, F h! y \5 J; B0 x请将以下材料合并为单个PDF文件,按照以下任一方式发送至邮箱,应聘材料主题注明:“应聘岗位-姓名-毕业院校/当前单位”0 B" R( U4 E& H; ?
1. 详细个人简历;4 ?' g1 b }, K
2. 研究计划或未来职业规划(1页,博士后/助理研究员申请者需提供);4 O, A* J3 Z4 | o6 q* _
3. 2–3位推荐人姓名及联系方式(博士后/助理研究员申请者需提供)。# p- e. z" N# c" Q5 r- r# C7 |
本招聘长期有效,招满即止。材料初审合格者,课题组将尽快安排线上/线下面试。所有申请信息严格保密。
2 i/ k+ C. n: E) G, q投递简历请选择:西湖大学张垲课题组
# Z& H. h5 g6 S6 n* w简历投递方式(可选任一):" ]' ^% p2 v) h- B" P5 f, c
: n6 |# u: p' o2 q7 `) q& f7 O J9 o
1. 扫描二维码投递简历;
$ i! O2 B' Z( Q$ c: l5 j3. 点击链接投递简历:https://data.bioart.com.cn/f/fKvK4m(复制链接至浏览器投递简历)
) k7 D9 u0 M* a# d! V课题组代表论文(* 表示共同第一作者)( x* Z4 t' C% m- r0 J( v
1. Zhang, K., Zemke N.R., Armand E.J., Ren, B. A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data. Nature Methods (2024)+ \" F3 S* h$ U0 e4 Y
2. Zhang, K.*, Hocker, J. D.*, Miller, M., Hou, X., Chiou, J., Poirion, O. B., ... Ren, B. A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome. Cell (2021)" {2 ^+ I" H3 A9 \* j* \
3. Zhang, K., Wang, M., Zhao, Y., & Wang, W. Taiji: System-level identification of key transcription factors reveals transcriptional waves in mouse embryonic development. Science Advances (2019)
0 h& u! M% B$ s3 i' G! n: W7 I4. Yu, B.*, Zhang, K.*, Milner, J., Toma, C., Chen, R., Scott-Browne, J., ... Goldrath, A. Epigenetic landscapes reveal transcription factors that regulate CD8+ T cell differentiation. Nature Immunology (2017)1 O; o0 w# M$ M
5. Zhang, K., Li, N., Ainsworth, R., & Wang, W. Systematic identification of protEIn combinations mediating chromatin looping. Nature Communications (2016)* j) Y3 y6 J( Q$ h& n
课题组招聘广告请发送至:bioarthr@bioart.com.cn; c& E0 [% N+ l" g G
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