国自然项目和文章的挽救实验,你的认识到哪层?
来源:市场资讯(来源:课题指南针)
上两期说了挽救实验的两种情况:同一个基因的沉默和过表达、以及A通过B调控的作用。今天我们说第三层:为什么要做分子的结构域和氨基酸突变的挽救实验?
国自然科学假说是这样的:A作为蛋白苏木化修饰酶,通过对B蛋白进行苏木化修饰(SUMOylation),进而诱导B蛋白的磷酸化修饰及细胞核转位,从而启动下游转录调控程序,进而促进周细胞向成纤维细胞转分化,最后促进纤维化和疾病进展。
上面的研究主题比较适合青C项目,细胞与分子层面的亮点有两个:
1)周细胞向成纤维细胞转分化;
2)A对B蛋白的苏木化修饰及其介导的转录重编程。
在这个项目中,为什么要做A和B蛋白的结构域截断体以及氨基酸突变的挽救实验呢?
因为假说默认了:
1)B的苏木化是后续事件(磷酸化和核转位)的必要条件;
2)A是通过其自身的苏木化酶活性直接作用的。
但科学要求我们排除例外:
伴随现象:苏木化只是磷酸化/核转位的伴随现象,而非原因。
间接作用:A可能只是招募了真正的苏木化酶C。
其它功能:A可能是通过其非酶活性的其他结构域(如D域)来起作用的。
因此,必须挽救实验来验证:
1. B蛋白苏木化位点突变实验(如K→R):当B无法被苏木化后,A是否还能促进其磷酸化和核转位?
若不能,则证明苏木化是必要的;若能,则假说不成立(可能是伴随现象)。
2. A蛋白苏木化酶活性结构域突变实验:当A失去酶活性后,是否还能促进B的苏木化及下游事件?
若不能,则证明是A亲自执行的修饰,而非间接招募其它蛋白。
3. A蛋白与B蛋白结合结构域缺失实验:当A无法结合B后,是否还能影响B?
若不能,则证明二者的直接相互作用是功能基础。
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